2000–2004 - Porządkowanie systemu i przygotowanie modernizacji

Część osadowa. Zakład wprowadził fermentację w zamkniętych komorach wraz z kotłownią spalającą biogaz. W 2003 roku zawarł umowę z wyspecjalizowaną firmą zajmującą się zagospodarowaniem odpadów z oczyszczalni.

System wodociągowy. Po połączeniu Izdebna Kościelnego z siecią miejską Zakład w 2001 roku wyłączył lokalną stację. System opierał się na SUW „Cegielniana”, „Dąbrówka” i „Wólka Grodziska”.

Dostępność usług. Na koniec 2003 roku z wodociągu korzystało około 77% mieszkańców gminy. Sieć wodociągowa liczyła około 182 km, a kanalizacyjna 51,2 km i obejmowała około połowy mieszkańców.

Przygotowanie inwestycji. W 2004 roku Zakład przeanalizował możliwości zagospodarowania osadów i potrzebę budowy instalacji suszenia. Równocześnie gmina przygotowywała kompleksową modernizację systemu i wniosek o wsparcie z Funduszu Spójności.